Povečanje učinkovitosti protimikrobnih snovi z elektroporacijo (2023-2026)

Povečanje učinkovitosti protimikrobnih snovi z elektroporacijo (2023-2026)
Vodja: prof. dr. Tadej Kotnik, Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko
Partner: UL Biotehniška fakulteta & Institut “Jožef Stefan”
Financiranje: ARIS – Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Šifra: J2-50064

 

Projekt financira Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije (ARIS).

Članica Univerze v Ljubljani

Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko

Šifra
J2-50064
Naziv projekta
Povečanje učinkovitosti protimikrobnih snovi z elektroporacijo
Obdobje
1.10.2023 - 30.09.2026
Letni obseg
1,19 FTE
Vodja

Tadej Kotnik

Veda
Tehnika - Sistemi in kibernetika
Sodelujoče RO

UL Fakulteta za elektrotehniko

UL Biotehniška fakulteta

Institut “Jožef Stefan”

Vsebinski opis projekta

Odpornost mikroorganizmov proti uveljavljenim antibiotikom predstavlja vse večjo globalno grožnjo zdravju ljudi, povezano z vse večjimi obolevnostjo, smrtnostjo, dolgotrajnostjo bolnišničnega zdravljenja in stroški zdravstvene oskrbe. Kronične bakterijske bolezni lahko tudi pomembno poslabšajo izid sočasnih virusnih okužb – tudi COVID-19. Zato sta iskanje alternativnih učinkovin in razvoj kombiniranih pristopov z več različnimi principi delovanja in tarčami ključna za boj proti nalezljivim boleznim v »post-antibiotični dobi«.
Med najobetavnejšimi metodami za kombinirane pristope je elektroporacija, pri kateri z izpostavitvijo mikroorganizmov kratkim visokonapetostnim pulzom permeabiliziramo njihove membrane in s tem omogočimo vnos snovi – tudi antibiotikov in alternativnih protimikrobnih učinkovin. Elektroporacija je ponovljiva in jo je mogoče optimizirati z izbiro parametrov pulzov, zaradi fizikalne narave njenega osnovnega mehanizma (nastanka por v lipidnem dvosloju membrane) pa mikroorganizmi proti njej ne morejo razviti odpornosti.
Dozdajšnje raziskave kombinirane uporabe protimikrobnih učinkovin z elektroporacijo so nakazale povečano inhibicijo mikroorganizmov, a sistematično ovrednotenje tega sinergijskega učinka – kvalitativne in kvantitativne odvisnosti od sestave bakterijske membrane, tipa in tarče protimikrobne snovi ter mehanizma odpornosti – še ni bilo narejeno. To pa je nujno za širše razumevanje in s tem večjo prepoznavnost elektroporacije kot uporabnega pristopa za povečanje protimikrobne učinkovitosti, še posebej pa za varno implementacijo tega pristopa v praksi. V tem projektu poskušamo sistematično ovrednotiti ta sinergijski učinek v odvisnosti od (i) sestave bakterijske ovojnice (gramnegativne (G–) / grampozitivne (G+) bakterije), (ii) odpornosti / neodpornosti seva, (iii) znotrajcelične tarče protimikrobne snovi, (iv) mehanizma odpornosti bakterij nanjo in (v) primerjave konvencionalnih antibiotikov / alternativnih protimikrobnih učinkovin.

Sestava projektne skupine

Link na SICRIS

Faze projekta in njihova realizacija

Projekt je sestavljen iz 5 delovnih sklopov s skupaj 12 nalogami, ki bodo dale 9 rezultatov. Najprej se bomo osredotočili na 5 reprezentativnih antibiotikov ter jih preučevali samostojno in v kombinaciji z elektroporacijo na 8 reprezentativnih bakterijah (4 G– in 4 G+), nato pa bomo študijo razširili še na 5 reprezentativnih netoksičnih alternativnih protimikrobnih učinkovin. Ekipa organizacije prijaviteljice (Fakultete za elektrotehniko Univerze v Ljubljani) pod vodstvom prof. dr. Tadeja Kotnika in prof. dr. Damijana Miklavčiča je med svetovno vodilnimi pri raziskovanju elektroporacije membran, ekipi z Biotehniške fakultete Univerze v Ljubljani (vodja izr. prof. dr. Anja Klančnik) in Inštituta Jožef Stefan (vodja viš. znan. sod. dr. Jerica Sabotič) pa imata komplementarna znanja o odpornosti bakterij in alternativnih protimikrobnih učinkovinah, kar zagotavlja ustrezno interdisciplinarnost skupine za uspešno realizacijo vseh ciljev projekta. V predlogu podrobno razčlenimo tudi oceno tveganj projekta ter ukrepe za njihovo odpravo oziroma zmanjšanje.
Raziskovalci so že združili svoje moči v manjši študiji (Lovšin et al., Front Microbiol 12:722232, 2021), s katero so pokazali, da je potenciacija pri minimalni inhibitorni koncentraciji močnejša za ampicilin (tarča: sinteza celične stene) kot za ciprofloksacin (podvajanje DNA) in tetraciklin (sinteza proteinov). To izkazuje primernost pristopa in izvedljivost, a tu predlagana širša sistematična študija terja večji obseg dela in namensko financiranje.
Rezultati projekta bodo tvorili osnovo za sistematično in učinkovito kombiniranje protimikrobnih učinkovin z elektroporacijo, za inaktivacijo tako grampozitivnih kot gramnegativnih bakterij pri nižjih koncentracijah antibiotikov (ali celo z netoksičnimi alternativnimi protimikrobnimi učinkovinami) ter pri nižji amplitudi in/ali številu električnih pulzov, z zmanjšanim vplivom na okolje in nižjimi stroški učinkovitega omejevanja bakterij, še posebej v kontaminiranih vodah.

Bibliografske reference

Link na COBISS